胡允恭在泰宁任县长一年多，没能与福建党与红军游击队取得直接联系。这时，在南方坚持三年游击战争的闽西、闽南红军游击队组成新四军二支队，闽北、闽东红军游击队组成三支队，都整编开赴到了皖南、苏北的抗日前线。正当胡允恭盟生辞退之意时，新四军军长叶挺从皖南发来一封信，希望他能通过桂系军阀的上层关系，取得合法身份到安徽工作，配合新四军的斗争。
程星龄胡允恭求助于福建省政府秘书长兼干训团教育长程星龄（解放后曾任湖南省政协主席），程星龄立即给湖南醴陵籍同乡、国民党军委会第一厅厅长刘斐写了推荐信。胡允恭去武汉，找到刘斐后，刘斐又给第五战区司令长官李宗仁和安徽省长廖磊各写了一封推荐信。年初，胡允恭被派到怀宁县当县长。
中共怀宁区委组织委员吴功，受命负责与这个叫胡邦宪的县长保持联络。胡允恭说：“今后我们一道工作，好好配合，一定要将怀宁县的工作做好。”
怀宁是个有80万人口的大县。胡允恭利用其合法身份，把郝笃先、吴功等地下党员安排在立法、人事、民政等重要岗位，并与鄂豫皖边区游击兵团第三大队长刘保罗（共产党员）、县政府军事科长杨盟山、第四区区长查化群（中共怀宁区委书记）形成了一个领导核地心，有力配合地下党和新四军在皖南的行动。
年下半年，新桂系开始反共，新四军东撤。这个叫胡邦宪的县长被迫辞职，不久又受到国民党安徽省当局通缉。年春，胡允恭只得又回到福建。此时，国民党福建省政府已内撤到了山区永安，“县政人员训练所”也迁至三元县，胡允恭继续到训练所当教员。
年6月，明溪县发生大刀会暴动，黄金旺带余名会徒冲进东南乡，捣毁区公所、乡公所，杀死区长、区员和乡长等7人，缴获区、乡公所的步枪10多支。时任县长和保安8团团长被省政府撤职。在这样情况下，胡允恭被陈仪邀至临时省会永安，被委任为明溪县长，去收拾混乱局面。
胡允恭到明溪时，新任保安8团团长袁时中已先到职，大刀会头目黄金旺被捕获。黄金旺在严刑逼供下承认，自己是受日寇利用，组织大刀会暴动。袁时中正准备用突然袭击的办法，派兵去包围闹大刀会的村庄，逮捕参加大刀的会员后，立即就地枪决，以儆效尤。胡允恭提出，要亲自去实地调查后再说。
他约了东南乡的几个绅士，要他们向几个大刀会员较多的村庄打招呼，让大刀会员不要害怕逃走。之后，带着几个随从开始调查。每到一个村庄，便集合居民和大刀会员开座谈会了解情况。村民们都说：“实在不知道黄金旺是汉奸，所以受了骗。”同时，他们也坦率地反映，区长、乡长平时欺男霸女，实在太坏了，所以才跟着黄金旺暴动。胡允恭去一些大刀会员家中查看，见他们家徒四壁，生活确实苦不堪言。
胡允恭回到县城后，胡允恭敬做袁时中的说服工作：“农民的生活已到了山穷水尽的地步，如果再捕杀大刀会员，势必造成大乱。”袁时中想想前任被撤职，害怕又捅出乱子，只好同意了他的主张。
这样，除逮捕的汉奸黄金旺被处决外，参加大刀会的农民未捕一人，也未派款一文，明溪县的局势平静下来。